Органами Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай являются избираемые им Президиум и комитеты.
Деятельность Президиума регламентируется Законом Республики Алтай от 27 марта 1998 года №3-44 «О Государственном Собрании-Эл Курултай Республики Алтай» и Положением о Президиуме, утвержденным Государственным Собранием-Эл Курултай.
Президиум Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай является координационным постоянно действующим и подотчетным Государственному Собранию-Эл Курултай органом, обеспечивающим организацию работы Парламента.
Президиум избирается на заседании Государственного Собрания-Эл Курултай, решением которого определяется численный и персональный состав Президиума. Заседание Президиума правомочно, при наличии не менее двух третей его состава.
Заседание Президиума Государственного Собрания-Эл Курултай созывается, по мере необходимости, но не менее одного раза в месяц. Заседания Президиума созывает и ведет Председатель Государственного Собрания-Эл Курултай, а в его отсутствие-заместитель Председателя. Заседание Президиума обязательно созывается, по требованию не менее половины членов Президиума.
Решения Президиума принимаются на его заседаниях большинством голосов от избранного состава Президиума. На заседаниях Президиума вправе участвовать, с совещательным голосом, любой депутат Республики Алтай.
Президиум Государственного Собрания-Эл Курултай осуществляет другие полномочия, предусмотренные законами Республики Алтай.
В состав Президиума по должности входят Председатель Государственного Собрания-Эл Курултай, заместители Председателя Государственного Собрания-Эл Курултай, председатели комитетов Государственного Собрания-Эл Курултай, а также другие депутаты Республики Алтай, избранные Государственным Собранием-Эл Курултай.
Президиум Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай:
1)организует подготовку заседаний сессий Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай, предварительное обсуждение предложений по вопросам повестки сессии;
2)созывает очередные сессии Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай;
(в ред.Конституционного закона Республики Алтай Республики Алтай от 03.06.2016г. №3-КРЗ)
3)выступает с инициативой созыва внеочередной сессии Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай;
4)координирует деятельность комитетов Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай;
5)обеспечивает подготовку и предоставление Государственному Собранию-Эл Курултай Республики Алтай документов и материалов, поступивших, в период между сессиями;
6)направляет для рассмотрения в комитеты Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай, Главе Республики Алтай, Председателю Правительства Республики Алтай, министерства, комитеты и другие органы и общественные объединения проекты законов Республики Алтай, которые предлагается внести на рассмотрение сессии Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай, для замечаний и предложений, а в случаях, предусмотренных законом, для дачи заключений;
7)оказывает содействие депутатам Республики Алтай в осуществлении ими своих полномочий и обеспечивает их необходимой информацией и материалами сессии;
8)организует подготовку и проведение обсуждения проектов законов Республики Алтай, а также наиболее важных вопросов жизни Республики Алтай;
9)публикует нормативные правовые акты, принятые Государственным Собранием-Эл Курултай Республики Алтай и его Президиумом;
10)контролирует между сессиями исполнение законов Республики Алтай, решений, принятых Государственным Собранием-Эл Курултай Республики Алтай, принимает меры для их исполнения. В этих целях, проводит проверки исполнения законов Республики Алтай, заслушивает на своих заседаниях ответственных за их исполнение;
11)предварительно обсуждает и рассматривает проекты нормативных правовых актов, предложенных на рассмотрение Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай;
12)осуществляет, по поручению Государственного Собрания-Эл Курултай Республики Алтай, и иные функции.